Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPA4Q13156 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA4Q13156 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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