Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF1Q13077 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
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