Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRN3Q13033 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRN3Q13033 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRN3Q13033 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
STRN3Q13033 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRN3Q13033 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRN3Q13033 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
STRN3Q13033 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRN3Q13033 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN3Q13033 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN3Q13033 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN3Q13033 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN3Q13033 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN3Q13033 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN3Q13033 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN3Q13033 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN3Q13033 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN3Q13033 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN3Q13033 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN3Q13033 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN3Q13033 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN3Q13033 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRN3Q13033 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRN3Q13033 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRN3Q13033 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRN3Q13033 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRN3Q13033 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRN3Q13033 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
STRN3Q13033 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRN3Q13033 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRN3Q13033 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRN3Q13033 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRN3Q13033 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRN3Q13033 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRN3Q13033 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRN3Q13033 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
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