Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXF2Q12947 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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