Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
FOXF1Q12946 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXF1Q12946 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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