Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPN13Q12923 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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