Protein–RNA interactions for Protein: Q12834

CDC20, Cell division cycle protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC20Q12834 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC20Q12834 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC20Q12834 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC20Q12834 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC20Q12834 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC20Q12834 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC20Q12834 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC20Q12834 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC20Q12834 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC20Q12834 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC20Q12834 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC20Q12834 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC20Q12834 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC20Q12834 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC20Q12834 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC20Q12834 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC20Q12834 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC20Q12834 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC20Q12834 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDC20Q12834 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms