Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAPQ12770 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
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