Protein–RNA interactions for Protein: Q10713

PMPCA, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCAQ10713 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PMPCAQ10713 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PMPCAQ10713 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PMPCAQ10713 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PMPCAQ10713 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PMPCAQ10713 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PMPCAQ10713 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PMPCAQ10713 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PMPCAQ10713 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PMPCAQ10713 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PMPCAQ10713 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PMPCAQ10713 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PMPCAQ10713 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PMPCAQ10713 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PMPCAQ10713 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PMPCAQ10713 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PMPCAQ10713 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PMPCAQ10713 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PMPCAQ10713 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PMPCAQ10713 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PMPCAQ10713 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PMPCAQ10713 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PMPCAQ10713 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PMPCAQ10713 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PMPCAQ10713 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PMPCAQ10713 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PMPCAQ10713 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PMPCAQ10713 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PMPCAQ10713 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PMPCAQ10713 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PMPCAQ10713 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PMPCAQ10713 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PMPCAQ10713 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PMPCAQ10713 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms