Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIPAL4Q0D2K0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms