Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPOCK1Q08629 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCK1Q08629 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms