Protein–RNA interactions for Protein: Q08004

BUD20, Bud site selection protein 20, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BUD20Q08004 IME2YJL106W 1938 nt6.82□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 GGA1YDR358W 1674 nt6.82□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 ALG9YNL219C 1668 nt6.82□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 AGX1YFL030W 1158 nt6.82□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 LIF1YGL090W 1266 nt6.82□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 HUR1YGL168W 333 nt6.82□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 CBR1YIL043C 855 nt6.82□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 NTG1YAL015C 1200 nt6.82□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 YLR463CYLR463C 552 nt6.82□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 JLP2YMR132C 627 nt6.82□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 YOR366WYOR366W 354 nt6.82□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 YPL088WYPL088W 1029 nt6.82□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 YPR076WYPR076W 375 nt6.82□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 NUP49YGL172W 1419 nt6.82□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 GAL80YML051W 1308 nt6.81□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 CDC1YDR182W 1476 nt6.81□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 YDL071CYDL071C 375 nt6.81□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 AIM24YJR080C 1185 nt6.81□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 YPT7YML001W 627 nt6.81□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt6.81□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 ATG8YBL078C 354 nt6.81□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 ATO2YNR002C 849 nt6.81□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 CYC2YOR037W 1101 nt6.81□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 SMX3YPR182W 261 nt6.81□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 BMT2YBR141C 1014 nt6.81□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 GPA1YHR005C 1419 nt6.81□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 MRE11YMR224C 2079 nt6.81□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 PAC2YER007W 1557 nt6.81□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 CDC19YAL038W 1503 nt6.81□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 GCN4YEL009C 846 nt6.8□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 RPL16AYIL133C 600 nt6.8□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 IML2YJL082W 2196 nt6.8□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 RPS30AYLR287C-A 192 nt6.8□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 YOL159CYOL159C 516 nt6.8□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 PRM2YIL037C 1971 nt6.8□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 CCT3YJL014W 1605 nt6.79□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 FCY22YER060W-A 1593 nt6.79□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 ATP8Q0080 147 nt6.79□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 IZH1YDR492W 951 nt6.79□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 YDR535CYDR535C 501 nt6.79□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 TMT1YER175C 900 nt6.79□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 YLL056CYLL056C 897 nt6.79□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 YLR171WYLR171W 390 nt6.79□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 CNA1YLR433C 1662 nt6.79□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 THI20YOL055C 1656 nt6.79□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 PLB3YOL011W 2061 nt6.79□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 GPH1YPR160W 2709 nt6.79□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 CDC37YDR168W 1521 nt6.79□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 ARP3YJR065C 1350 nt6.79□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 SLA2YNL243W 2907 nt6.78□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 MSB3YNL293W 1902 nt6.78□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 GYP1YOR070C 1914 nt6.78□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 MRH1YDR033W 963 nt6.78□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 ISC10YER180C 804 nt6.78□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 YJR087WYJR087W 351 nt6.78□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt6.78□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 YSF3YNL138W-A 258 nt6.78□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 HBN1YCL026C-B 582 nt6.78□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 COX15YER141W 1461 nt6.78□□□□□ -1.32
BUD20Q08004 RGD2YFL047W 2145 nt6.77□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 UTP18YJL069C 1785 nt6.77□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 YCL075WYCL075W 441 nt6.77□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 YER145C-AYER145C-A 438 nt6.77□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 YGR039WYGR039W 312 nt6.77□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 RME1YGR044C 903 nt6.77□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 IES3YLR052W 753 nt6.77□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 AIM32YML050W 936 nt6.77□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 GRE1YPL223C 507 nt6.77□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 snR41snR41 95 nt6.77□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 YJL045WYJL045W 1905 nt6.77□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 YBR241CYBR241C 1467 nt6.77□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 LOC1YFR001W 615 nt6.76□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 YGL199CYGL199C 471 nt6.76□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 SNL1YIL016W 480 nt6.76□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 SYN8YAL014C 768 nt6.76□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 YKL066WYKL066W 444 nt6.76□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 RDN5-2RDN5-2 119 nt6.76□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 RDN5-3RDN5-3 119 nt6.76□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 RDN5-4RDN5-4 119 nt6.76□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 RDN5-5RDN5-5 119 nt6.76□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 BRX1YOL077C 876 nt6.76□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 ATG5YPL149W 885 nt6.76□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 CYB2YML054C 1776 nt6.76□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 SSC1YJR045C 1965 nt6.76□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 SEC23YPR181C 2307 nt6.76□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 GSH1YJL101C 2037 nt6.76□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 TAH11YJR046W 1815 nt6.76□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 RRP3YHR065C 1506 nt6.76□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 SLF1YDR515W 1344 nt6.76□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 RTT109YLL002W 1311 nt6.76□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 SUC2YIL162W 1599 nt6.75□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 YDL183CYDL183C 963 nt6.75□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 PUG1YER185W 912 nt6.75□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 ARC1YGL105W 1131 nt6.75□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt6.75□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 GRE3YHR104W 984 nt6.75□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 YLR224WYLR224W 1110 nt6.75□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 CTK3YML112W 891 nt6.75□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 AIM39YOL053W 1188 nt6.75□□□□□ -1.33
BUD20Q08004 RPL3YOR063W 1164 nt6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16 ms