Protein–RNA interactions for Protein: Q07326

PIGF, Phosphatidylinositol-glycan biosynthesis class F protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGFQ07326 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIGFQ07326 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIGFQ07326 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms