Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CTDSPL2Q05D32 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms