Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC18A2Q05940 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC18A2Q05940 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms