Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRSF11Q05519 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms