Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD164Q04900 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD164Q04900 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD164Q04900 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD164Q04900 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD164Q04900 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD164Q04900 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD164Q04900 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD164Q04900 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CD164Q04900 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD164Q04900 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD164Q04900 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD164Q04900 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD164Q04900 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD164Q04900 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CD164Q04900 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD164Q04900 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD164Q04900 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD164Q04900 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD164Q04900 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD164Q04900 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD164Q04900 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD164Q04900 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD164Q04900 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD164Q04900 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD164Q04900 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CD164Q04900 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD164Q04900 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD164Q04900 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD164Q04900 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD164Q04900 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD164Q04900 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD164Q04900 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD164Q04900 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD164Q04900 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD164Q04900 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD164Q04900 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD164Q04900 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD164Q04900 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CD164Q04900 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD164Q04900 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD164Q04900 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD164Q04900 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD164Q04900 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD164Q04900 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD164Q04900 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD164Q04900 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD164Q04900 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CD164Q04900 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD164Q04900 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD164Q04900 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD164Q04900 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD164Q04900 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD164Q04900 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CD164Q04900 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD164Q04900 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD164Q04900 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CD164Q04900 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD164Q04900 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD164Q04900 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CD164Q04900 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CD164Q04900 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD164Q04900 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD164Q04900 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD164Q04900 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD164Q04900 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD164Q04900 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD164Q04900 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD164Q04900 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CD164Q04900 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD164Q04900 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CD164Q04900 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CD164Q04900 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CD164Q04900 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD164Q04900 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD164Q04900 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD164Q04900 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CD164Q04900 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD164Q04900 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD164Q04900 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CD164Q04900 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD164Q04900 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD164Q04900 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD164Q04900 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD164Q04900 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD164Q04900 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD164Q04900 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD164Q04900 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD164Q04900 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD164Q04900 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD164Q04900 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD164Q04900 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD164Q04900 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CD164Q04900 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD164Q04900 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD164Q04900 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CD164Q04900 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CD164Q04900 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CD164Q04900 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CD164Q04900 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms