Protein–RNA interactions for Protein: Q04759

PRKCQ, Protein kinase C theta type, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQQ04759 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCQQ04759 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms