Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARID5AQ03989 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID5AQ03989 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms