Protein–RNA interactions for Protein: Q03169

TNFAIP2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP2Q03169 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFAIP2Q03169 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP2Q03169 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP2Q03169 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms