Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF8Q02556 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IRF8Q02556 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
IRF8Q02556 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.33■■□□□ 1
IRF8Q02556 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF8Q02556 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF8Q02556 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF8Q02556 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF8Q02556 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF8Q02556 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IRF8Q02556 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF8Q02556 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF8Q02556 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF8Q02556 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF8Q02556 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF8Q02556 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF8Q02556 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF8Q02556 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF8Q02556 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF8Q02556 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF8Q02556 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF8Q02556 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF8Q02556 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF8Q02556 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF8Q02556 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF8Q02556 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF8Q02556 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF8Q02556 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF8Q02556 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF8Q02556 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF8Q02556 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF8Q02556 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF8Q02556 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF8Q02556 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF8Q02556 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF8Q02556 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF8Q02556 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF8Q02556 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IRF8Q02556 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF8Q02556 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF8Q02556 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF8Q02556 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF8Q02556 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF8Q02556 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF8Q02556 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF8Q02556 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF8Q02556 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF8Q02556 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF8Q02556 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF8Q02556 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IRF8Q02556 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF8Q02556 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF8Q02556 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IRF8Q02556 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF8Q02556 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF8Q02556 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF8Q02556 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF8Q02556 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF8Q02556 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IRF8Q02556 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF8Q02556 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF8Q02556 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF8Q02556 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF8Q02556 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IRF8Q02556 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF8Q02556 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF8Q02556 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF8Q02556 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF8Q02556 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF8Q02556 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IRF8Q02556 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF8Q02556 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF8Q02556 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF8Q02556 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF8Q02556 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF8Q02556 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF8Q02556 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IRF8Q02556 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF8Q02556 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF8Q02556 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms