Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC6A3Q01959 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A3Q01959 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms