Protein–RNA interactions for Protein: Q01664

TFAP4, Transcription factor AP-4, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP4Q01664 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TFAP4Q01664 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TFAP4Q01664 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TFAP4Q01664 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TFAP4Q01664 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFAP4Q01664 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFAP4Q01664 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFAP4Q01664 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFAP4Q01664 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TFAP4Q01664 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFAP4Q01664 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFAP4Q01664 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TFAP4Q01664 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFAP4Q01664 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFAP4Q01664 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFAP4Q01664 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TFAP4Q01664 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TFAP4Q01664 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TFAP4Q01664 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TFAP4Q01664 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TFAP4Q01664 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TFAP4Q01664 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms