Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MS4A2Q01362 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms