Protein–RNA interactions for Protein: Q01201

RELB, Transcription factor RelB, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELBQ01201 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RELBQ01201 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RELBQ01201 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RELBQ01201 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RELBQ01201 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RELBQ01201 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RELBQ01201 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RELBQ01201 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RELBQ01201 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RELBQ01201 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RELBQ01201 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELBQ01201 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELBQ01201 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELBQ01201 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELBQ01201 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELBQ01201 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELBQ01201 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELBQ01201 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELBQ01201 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RELBQ01201 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELBQ01201 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELBQ01201 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELBQ01201 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELBQ01201 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELBQ01201 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELBQ01201 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELBQ01201 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELBQ01201 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELBQ01201 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELBQ01201 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RELBQ01201 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELBQ01201 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELBQ01201 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELBQ01201 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELBQ01201 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELBQ01201 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELBQ01201 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELBQ01201 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RELBQ01201 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELBQ01201 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELBQ01201 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELBQ01201 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RELBQ01201 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELBQ01201 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RELBQ01201 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELBQ01201 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELBQ01201 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELBQ01201 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELBQ01201 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RELBQ01201 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RELBQ01201 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RELBQ01201 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RELBQ01201 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RELBQ01201 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RELBQ01201 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RELBQ01201 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RELBQ01201 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RELBQ01201 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RELBQ01201 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RELBQ01201 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RELBQ01201 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RELBQ01201 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RELBQ01201 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RELBQ01201 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RELBQ01201 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RELBQ01201 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RELBQ01201 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RELBQ01201 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RELBQ01201 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RELBQ01201 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RELBQ01201 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RELBQ01201 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RELBQ01201 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RELBQ01201 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RELBQ01201 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RELBQ01201 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELBQ01201 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELBQ01201 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELBQ01201 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELBQ01201 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELBQ01201 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELBQ01201 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RELBQ01201 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELBQ01201 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELBQ01201 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELBQ01201 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RELBQ01201 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELBQ01201 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELBQ01201 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELBQ01201 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELBQ01201 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELBQ01201 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELBQ01201 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELBQ01201 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELBQ01201 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELBQ01201 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RELBQ01201 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELBQ01201 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELBQ01201 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RELBQ01201 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms