Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD83Q01151 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD83Q01151 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD83Q01151 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD83Q01151 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD83Q01151 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD83Q01151 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD83Q01151 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD83Q01151 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD83Q01151 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD83Q01151 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD83Q01151 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CD83Q01151 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD83Q01151 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD83Q01151 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD83Q01151 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD83Q01151 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD83Q01151 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD83Q01151 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CD83Q01151 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD83Q01151 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD83Q01151 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD83Q01151 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD83Q01151 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD83Q01151 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD83Q01151 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD83Q01151 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD83Q01151 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD83Q01151 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CD83Q01151 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD83Q01151 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD83Q01151 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD83Q01151 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD83Q01151 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD83Q01151 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD83Q01151 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD83Q01151 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD83Q01151 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD83Q01151 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD83Q01151 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD83Q01151 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD83Q01151 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD83Q01151 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD83Q01151 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD83Q01151 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD83Q01151 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD83Q01151 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD83Q01151 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD83Q01151 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD83Q01151 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD83Q01151 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD83Q01151 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD83Q01151 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD83Q01151 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD83Q01151 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD83Q01151 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD83Q01151 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD83Q01151 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD83Q01151 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD83Q01151 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD83Q01151 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD83Q01151 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD83Q01151 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD83Q01151 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CD83Q01151 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CD83Q01151 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD83Q01151 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD83Q01151 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD83Q01151 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD83Q01151 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD83Q01151 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD83Q01151 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD83Q01151 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD83Q01151 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD83Q01151 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD83Q01151 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD83Q01151 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD83Q01151 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD83Q01151 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CD83Q01151 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD83Q01151 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD83Q01151 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD83Q01151 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD83Q01151 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD83Q01151 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD83Q01151 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD83Q01151 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD83Q01151 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD83Q01151 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CD83Q01151 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CD83Q01151 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD83Q01151 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD83Q01151 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD83Q01151 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD83Q01151 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CD83Q01151 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD83Q01151 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD83Q01151 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD83Q01151 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD83Q01151 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms