Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCCQ00597 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCCQ00597 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms