Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK3Q00526 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms