Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CBX1P83916 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CBX1P83916 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CBX1P83916 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBX1P83916 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBX1P83916 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBX1P83916 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBX1P83916 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBX1P83916 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBX1P83916 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBX1P83916 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBX1P83916 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBX1P83916 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX1P83916 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX1P83916 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX1P83916 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX1P83916 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX1P83916 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX1P83916 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX1P83916 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX1P83916 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX1P83916 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX1P83916 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX1P83916 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX1P83916 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX1P83916 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX1P83916 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX1P83916 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX1P83916 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX1P83916 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX1P83916 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX1P83916 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX1P83916 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX1P83916 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX1P83916 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX1P83916 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX1P83916 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX1P83916 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX1P83916 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX1P83916 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX1P83916 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX1P83916 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX1P83916 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX1P83916 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX1P83916 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX1P83916 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX1P83916 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX1P83916 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX1P83916 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX1P83916 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX1P83916 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX1P83916 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX1P83916 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX1P83916 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX1P83916 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX1P83916 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX1P83916 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX1P83916 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX1P83916 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX1P83916 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX1P83916 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX1P83916 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX1P83916 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX1P83916 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX1P83916 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX1P83916 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX1P83916 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX1P83916 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX1P83916 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX1P83916 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX1P83916 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX1P83916 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX1P83916 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX1P83916 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX1P83916 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX1P83916 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX1P83916 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX1P83916 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX1P83916 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX1P83916 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX1P83916 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX1P83916 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CBX1P83916 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CBX1P83916 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CBX1P83916 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CBX1P83916 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CBX1P83916 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX1P83916 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX1P83916 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX1P83916 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX1P83916 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX1P83916 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX1P83916 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX1P83916 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX1P83916 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX1P83916 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX1P83916 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX1P83916 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX1P83916 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX1P83916 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms