Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUCB2P80303 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NUCB2P80303 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms