Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P63121 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms