Protein–RNA interactions for Protein: P62899

RPL31, 60S ribosomal protein L31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL31P62899 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL31P62899 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL31P62899 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL31P62899 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL31P62899 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL31P62899 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL31P62899 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL31P62899 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL31P62899 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL31P62899 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL31P62899 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL31P62899 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL31P62899 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL31P62899 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL31P62899 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL31P62899 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL31P62899 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL31P62899 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL31P62899 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL31P62899 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL31P62899 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL31P62899 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL31P62899 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL31P62899 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL31P62899 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL31P62899 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL31P62899 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL31P62899 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL31P62899 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL31P62899 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL31P62899 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL31P62899 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL31P62899 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL31P62899 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL31P62899 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL31P62899 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL31P62899 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL31P62899 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL31P62899 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL31P62899 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL31P62899 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL31P62899 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL31P62899 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL31P62899 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL31P62899 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL31P62899 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL31P62899 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL31P62899 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL31P62899 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL31P62899 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL31P62899 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL31P62899 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL31P62899 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL31P62899 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL31P62899 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL31P62899 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL31P62899 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL31P62899 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL31P62899 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL31P62899 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL31P62899 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL31P62899 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL31P62899 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL31P62899 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL31P62899 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL31P62899 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL31P62899 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL31P62899 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL31P62899 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL31P62899 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL31P62899 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL31P62899 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL31P62899 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL31P62899 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL31P62899 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL31P62899 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL31P62899 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL31P62899 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL31P62899 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL31P62899 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL31P62899 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL31P62899 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL31P62899 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL31P62899 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL31P62899 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL31P62899 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL31P62899 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL31P62899 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL31P62899 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL31P62899 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL31P62899 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL31P62899 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL31P62899 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL31P62899 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL31P62899 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL31P62899 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL31P62899 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL31P62899 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL31P62899 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL31P62899 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms