Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P62891 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P62891 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P62891 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P62891 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P62891 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P62891 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P62891 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P62891 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P62891 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P62891 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P62891 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P62891 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P62891 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P62891 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P62891 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P62891 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P62891 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P62891 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P62891 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P62891 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P62891 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P62891 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P62891 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P62891 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P62891 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P62891 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P62891 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P62891 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P62891 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P62891 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P62891 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P62891 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P62891 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P62891 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39P62891 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P62891 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P62891 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P62891 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P62891 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P62891 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P62891 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P62891 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P62891 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P62891 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P62891 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P62891 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P62891 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39P62891 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P62891 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P62891 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P62891 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P62891 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P62891 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P62891 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P62891 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P62891 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P62891 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P62891 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P62891 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P62891 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39P62891 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P62891 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P62891 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P62891 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P62891 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P62891 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P62891 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P62891 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P62891 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P62891 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P62891 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P62891 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P62891 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P62891 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P62891 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P62891 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P62891 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39P62891 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P62891 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P62891 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P62891 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P62891 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P62891 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P62891 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P62891 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P62891 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P62891 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P62891 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P62891 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P62891 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P62891 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL39P62891 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL39P62891 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL39P62891 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL39P62891 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL39P62891 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL39P62891 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL39P62891 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P62891 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms