Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
VSNL1P62760 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VSNL1P62760 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms