Protein–RNA interactions for Protein: P61601

NCALD, Neurocalcin-delta, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCALDP61601 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCALDP61601 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCALDP61601 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCALDP61601 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCALDP61601 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCALDP61601 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NCALDP61601 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCALDP61601 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCALDP61601 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCALDP61601 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCALDP61601 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCALDP61601 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCALDP61601 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCALDP61601 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCALDP61601 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCALDP61601 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCALDP61601 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCALDP61601 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCALDP61601 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCALDP61601 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NCALDP61601 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCALDP61601 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCALDP61601 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCALDP61601 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCALDP61601 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCALDP61601 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCALDP61601 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCALDP61601 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCALDP61601 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCALDP61601 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCALDP61601 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCALDP61601 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCALDP61601 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCALDP61601 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCALDP61601 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCALDP61601 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCALDP61601 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NCALDP61601 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NCALDP61601 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
NCALDP61601 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCALDP61601 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCALDP61601 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCALDP61601 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCALDP61601 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCALDP61601 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCALDP61601 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCALDP61601 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCALDP61601 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCALDP61601 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCALDP61601 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCALDP61601 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCALDP61601 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCALDP61601 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCALDP61601 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCALDP61601 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCALDP61601 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCALDP61601 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCALDP61601 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCALDP61601 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCALDP61601 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCALDP61601 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCALDP61601 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCALDP61601 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCALDP61601 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCALDP61601 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCALDP61601 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NCALDP61601 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCALDP61601 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NCALDP61601 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCALDP61601 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCALDP61601 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCALDP61601 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCALDP61601 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCALDP61601 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCALDP61601 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCALDP61601 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCALDP61601 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCALDP61601 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCALDP61601 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCALDP61601 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCALDP61601 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCALDP61601 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCALDP61601 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCALDP61601 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCALDP61601 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCALDP61601 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCALDP61601 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCALDP61601 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCALDP61601 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCALDP61601 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCALDP61601 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCALDP61601 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCALDP61601 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCALDP61601 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCALDP61601 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCALDP61601 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NCALDP61601 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCALDP61601 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NCALDP61601 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCALDP61601 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms