Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVFC1-1P60608 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFC1-1P60608 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms