Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP4BP1P59074 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms