Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
FBXW4P57775 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXW4P57775 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXW4P57775 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXW4P57775 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXW4P57775 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXW4P57775 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXW4P57775 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXW4P57775 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXW4P57775 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXW4P57775 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXW4P57775 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXW4P57775 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXW4P57775 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXW4P57775 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXW4P57775 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXW4P57775 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXW4P57775 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXW4P57775 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXW4P57775 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXW4P57775 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXW4P57775 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXW4P57775 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXW4P57775 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXW4P57775 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXW4P57775 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXW4P57775 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXW4P57775 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXW4P57775 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXW4P57775 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXW4P57775 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms