Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA9P57773 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA9P57773 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA9P57773 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA9P57773 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJA9P57773 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA9P57773 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA9P57773 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA9P57773 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA9P57773 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA9P57773 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA9P57773 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA9P57773 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA9P57773 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJA9P57773 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJA9P57773 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJA9P57773 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJA9P57773 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJA9P57773 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJA9P57773 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJA9P57773 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GJA9P57773 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJA9P57773 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJA9P57773 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJA9P57773 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJA9P57773 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA9P57773 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA9P57773 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA9P57773 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA9P57773 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA9P57773 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA9P57773 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA9P57773 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA9P57773 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA9P57773 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA9P57773 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA9P57773 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA9P57773 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA9P57773 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJA9P57773 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA9P57773 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA9P57773 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA9P57773 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA9P57773 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA9P57773 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA9P57773 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJA9P57773 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA9P57773 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA9P57773 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA9P57773 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA9P57773 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA9P57773 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA9P57773 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJA9P57773 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GJA9P57773 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GJA9P57773 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GJA9P57773 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJA9P57773 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJA9P57773 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJA9P57773 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJA9P57773 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJA9P57773 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJA9P57773 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA9P57773 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA9P57773 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA9P57773 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA9P57773 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA9P57773 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA9P57773 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA9P57773 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA9P57773 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA9P57773 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA9P57773 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA9P57773 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA9P57773 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA9P57773 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA9P57773 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJA9P57773 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJA9P57773 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJA9P57773 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJA9P57773 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJA9P57773 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJA9P57773 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJA9P57773 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GJA9P57773 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJA9P57773 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJA9P57773 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJA9P57773 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJA9P57773 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJA9P57773 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJA9P57773 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJA9P57773 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJA9P57773 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJA9P57773 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJA9P57773 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJA9P57773 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJA9P57773 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJA9P57773 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJA9P57773 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GJA9P57773 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms