Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2BFSP57053 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2BFSP57053 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms