Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms