Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLTPP55058 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLTPP55058 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLTPP55058 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLTPP55058 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PLTPP55058 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLTPP55058 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLTPP55058 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLTPP55058 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLTPP55058 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLTPP55058 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLTPP55058 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLTPP55058 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLTPP55058 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLTPP55058 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLTPP55058 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLTPP55058 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLTPP55058 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLTPP55058 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLTPP55058 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLTPP55058 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLTPP55058 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLTPP55058 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLTPP55058 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLTPP55058 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLTPP55058 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLTPP55058 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLTPP55058 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLTPP55058 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLTPP55058 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLTPP55058 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLTPP55058 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLTPP55058 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLTPP55058 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PLTPP55058 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PLTPP55058 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PLTPP55058 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PLTPP55058 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLTPP55058 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLTPP55058 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLTPP55058 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PLTPP55058 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLTPP55058 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLTPP55058 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLTPP55058 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLTPP55058 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLTPP55058 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLTPP55058 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLTPP55058 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLTPP55058 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLTPP55058 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLTPP55058 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLTPP55058 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLTPP55058 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLTPP55058 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLTPP55058 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLTPP55058 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLTPP55058 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLTPP55058 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PLTPP55058 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLTPP55058 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLTPP55058 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLTPP55058 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLTPP55058 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLTPP55058 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLTPP55058 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLTPP55058 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLTPP55058 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLTPP55058 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLTPP55058 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLTPP55058 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLTPP55058 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLTPP55058 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLTPP55058 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLTPP55058 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLTPP55058 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLTPP55058 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLTPP55058 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLTPP55058 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLTPP55058 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLTPP55058 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLTPP55058 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLTPP55058 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLTPP55058 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLTPP55058 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLTPP55058 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLTPP55058 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLTPP55058 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLTPP55058 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLTPP55058 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLTPP55058 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLTPP55058 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLTPP55058 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLTPP55058 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLTPP55058 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLTPP55058 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLTPP55058 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLTPP55058 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLTPP55058 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLTPP55058 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms