Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EMP3P54852 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMP3P54852 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMP3P54852 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMP3P54852 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMP3P54852 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMP3P54852 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMP3P54852 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMP3P54852 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMP3P54852 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
EMP3P54852 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EMP3P54852 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
EMP3P54852 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
EMP3P54852 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EMP3P54852 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EMP3P54852 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EMP3P54852 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EMP3P54852 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMP3P54852 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMP3P54852 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EMP3P54852 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EMP3P54852 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EMP3P54852 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EMP3P54852 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EMP3P54852 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EMP3P54852 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMP3P54852 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EMP3P54852 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EMP3P54852 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EMP3P54852 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMP3P54852 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMP3P54852 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMP3P54852 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMP3P54852 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMP3P54852 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMP3P54852 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EMP3P54852 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMP3P54852 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMP3P54852 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EMP3P54852 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EMP3P54852 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EMP3P54852 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EMP3P54852 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EMP3P54852 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EMP3P54852 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMP3P54852 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EMP3P54852 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMP3P54852 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EMP3P54852 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMP3P54852 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMP3P54852 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMP3P54852 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EMP3P54852 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMP3P54852 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EMP3P54852 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EMP3P54852 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMP3P54852 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EMP3P54852 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EMP3P54852 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMP3P54852 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EMP3P54852 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMP3P54852 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EMP3P54852 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMP3P54852 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMP3P54852 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMP3P54852 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EMP3P54852 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EMP3P54852 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMP3P54852 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMP3P54852 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EMP3P54852 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EMP3P54852 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EMP3P54852 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EMP3P54852 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMP3P54852 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EMP3P54852 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMP3P54852 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EMP3P54852 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMP3P54852 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMP3P54852 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EMP3P54852 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMP3P54852 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMP3P54852 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMP3P54852 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMP3P54852 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EMP3P54852 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EMP3P54852 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMP3P54852 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EMP3P54852 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EMP3P54852 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMP3P54852 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMP3P54852 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMP3P54852 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMP3P54852 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMP3P54852 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EMP3P54852 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMP3P54852 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMP3P54852 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMP3P54852 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMP3P54852 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms