Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EMP1P54849 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EMP1P54849 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EMP1P54849 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EMP1P54849 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EMP1P54849 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EMP1P54849 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EMP1P54849 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EMP1P54849 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EMP1P54849 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EMP1P54849 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EMP1P54849 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EMP1P54849 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EMP1P54849 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EMP1P54849 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EMP1P54849 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EMP1P54849 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EMP1P54849 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EMP1P54849 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EMP1P54849 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EMP1P54849 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EMP1P54849 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EMP1P54849 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EMP1P54849 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EMP1P54849 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EMP1P54849 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EMP1P54849 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EMP1P54849 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EMP1P54849 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EMP1P54849 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EMP1P54849 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EMP1P54849 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EMP1P54849 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EMP1P54849 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EMP1P54849 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EMP1P54849 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EMP1P54849 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EMP1P54849 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EMP1P54849 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EMP1P54849 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EMP1P54849 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EMP1P54849 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EMP1P54849 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EMP1P54849 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EMP1P54849 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EMP1P54849 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EMP1P54849 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EMP1P54849 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EMP1P54849 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EMP1P54849 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EMP1P54849 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EMP1P54849 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EMP1P54849 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EMP1P54849 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EMP1P54849 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EMP1P54849 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EMP1P54849 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EMP1P54849 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EMP1P54849 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EMP1P54849 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EMP1P54849 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EMP1P54849 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EMP1P54849 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EMP1P54849 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EMP1P54849 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EMP1P54849 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EMP1P54849 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EMP1P54849 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EMP1P54849 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EMP1P54849 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EMP1P54849 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EMP1P54849 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EMP1P54849 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EMP1P54849 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EMP1P54849 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EMP1P54849 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EMP1P54849 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EMP1P54849 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EMP1P54849 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EMP1P54849 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EMP1P54849 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EMP1P54849 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EMP1P54849 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EMP1P54849 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EMP1P54849 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EMP1P54849 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EMP1P54849 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EMP1P54849 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EMP1P54849 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EMP1P54849 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
EMP1P54849 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EMP1P54849 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EMP1P54849 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMP1P54849 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMP1P54849 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EMP1P54849 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMP1P54849 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMP1P54849 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMP1P54849 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMP1P54849 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms