Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EPHB1P54762 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB1P54762 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms