Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EPHB3P54753 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB3P54753 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms