Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD23BP54727 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD23BP54727 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms