Protein–RNA interactions for Protein: P53127

SNT2, E3 ubiquitin-protein ligase SNT2, yeast

Predictions only

Length 1,403 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SNT2	P53127	TAF7	YMR227C	1773 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SNT2	P53127	YHL034W-A	YHL034W-A	462 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SNT2	P53127	RPL8B	YLL045C	771 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SNT2	P53127	CDC16	YKL022C	2523 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SNT2	P53127	VHC1	YBR235W	3363 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SNT2	P53127	CAX4	YGR036C	720 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SNT2	P53127	YJR128W	YJR128W	360 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SNT2	P53127	YPT7	YML001W	627 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SNT2	P53127	NOP4	YPL043W	2058 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SNT2	P53127	YLH47	YPR125W	1365 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SNT2	P53127	KCH1	YJR054W	1494 nt		4.93	□□□□□ -1.62
SNT2	P53127	YML020W	YML020W	1995 nt		4.93	□□□□□ -1.62
SNT2	P53127	ECM22	YLR228C	2445 nt		4.93	□□□□□ -1.62
SNT2	P53127	YHL026C	YHL026C	948 nt		4.93	□□□□□ -1.62
SNT2	P53127	MAK16	YAL025C	921 nt		4.93	□□□□□ -1.62
SNT2	P53127	AUR1	YKL004W	1206 nt		4.93	□□□□□ -1.62
SNT2	P53127	snR42	snR42	351 nt		4.93	□□□□□ -1.62
SNT2	P53127	RPB2	YOR151C	3675 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SNT2	P53127	BMH2	YDR099W	822 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SNT2	P53127	YOR387C	YOR387C	621 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SNT2	P53127	SYT1	YPR095C	3681 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SNT2	P53127	YHR202W	YHR202W	1809 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SNT2	P53127	BUB1	YGR188C	3066 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SNT2	P53127	NUP60	YAR002W	1620 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SNT2	P53127	SNF3	YDL194W	2655 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SNT2	P53127	GOT1	YMR292W	417 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SNT2	P53127	SFI1	YLL003W	2841 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SNT2	P53127	MEC3	YLR288C	1425 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SNT2	P53127	MRPL11	YDL202W	750 nt		4.9	□□□□□ -1.62
SNT2	P53127	YER084W	YER084W	387 nt		4.9	□□□□□ -1.62
SNT2	P53127	TPM1	YNL079C	600 nt		4.9	□□□□□ -1.62
SNT2	P53127	TIR2	YOR010C	756 nt		4.9	□□□□□ -1.62
SNT2	P53127	PFK26	YIL107C	2484 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SNT2	P53127	RTT109	YLL002W	1311 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SNT2	P53127	MRP13	YGR084C	1020 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SNT2	P53127	YIR020W-A	YIR020W-A	243 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SNT2	P53127	NAT3	YPR131C	588 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SNT2	P53127	YBR126W-A	YBR126W-A	207 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SNT2	P53127	SEC18	YBR080C	2277 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SNT2	P53127	SEC9	YGR009C	1956 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SNT2	P53127	DNM1	YLL001W	2274 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SNT2	P53127	YKL050C	YKL050C	2769 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SNT2	P53127	SWP82	YFL049W	1872 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SNT2	P53127	HAT2	YEL056W	1206 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SNT2	P53127	OMS1	YDR316W	1416 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SNT2	P53127	TCB2	YNL087W	3537 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SNT2	P53127	UPS3	YDR185C	540 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SNT2	P53127	COX14	YML129C	213 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SNT2	P53127	NTO1	YPR031W	2247 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SNT2	P53127	SOF1	YLL011W	1470 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SNT2	P53127	PCA1	YBR295W	3651 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SNT2	P53127	tQ(UUG)B	tQ(UUG)B	72 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SNT2	P53127	YAL004W	YAL004W	648 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SNT2	P53127	ERG2	YMR202W	669 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SNT2	P53127	WRS1	YOL097C	1299 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SNT2	P53127	THR4	YCR053W	1545 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SNT2	P53127	SOP4	YJL192C	705 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SNT2	P53127	YNL320W	YNL320W	855 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SNT2	P53127	DNA2	YHR164C	4569 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SNT2	P53127	PRP9	YDL030W	1593 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SNT2	P53127	PRP43	YGL120C	2304 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SNT2	P53127	PRP40	YKL012W	1752 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SNT2	P53127	TEM1	YML064C	738 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SNT2	P53127	PDE1	YGL248W	1110 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SNT2	P53127	YKL033W-A	YKL033W-A	711 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SNT2	P53127	YKL107W	YKL107W	930 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SNT2	P53127	RAD54	YGL163C	2697 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SNT2	P53127	YRA2	YKL214C	612 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SNT2	P53127	VPS21	YOR089C	633 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SNT2	P53127	YPL113C	YPL113C	1191 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SNT2	P53127	GRE1	YPL223C	507 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SNT2	P53127	SPC97	YHR172W	2472 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SNT2	P53127	YIL054W	YIL054W	318 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SNT2	P53127	YPL260W	YPL260W	1656 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SNT2	P53127	GPR1	YDL035C	2886 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SNT2	P53127	MRPS35	YGR165W	1038 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SNT2	P53127	AVT7	YIL088C	1473 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SNT2	P53127	FAA3	YIL009W	2085 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SNT2	P53127	YOL153C	YOL153C	1746 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SNT2	P53127	CHO2	YGR157W	2610 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SNT2	P53127	PRE8	YML092C	753 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SNT2	P53127	NCE103	YNL036W	666 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SNT2	P53127	BLM10	YFL007W	6432 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SNT2	P53127	NMA111	YNL123W	2994 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SNT2	P53127	STR2	YJR130C	1920 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SNT2	P53127	HCA4	YJL033W	2313 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SNT2	P53127	OSH3	YHR073W	2991 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SNT2	P53127	GAL11	YOL051W	3246 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SNT2	P53127	ENA2	YDR039C	3276 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SNT2	P53127	ENA1	YDR040C	3276 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SNT2	P53127	RRN7	YJL025W	1545 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SNT2	P53127	DEG1	YFL001W	1329 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SNT2	P53127	YGR053C	YGR053C	852 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SNT2	P53127	YLR346C	YLR346C	306 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SNT2	P53127	APL6	YGR261C	2430 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SNT2	P53127	THI20	YOL055C	1656 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SNT2	P53127	UBP5	YER144C	2418 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SNT2	P53127	APC11	YDL008W	498 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SNT2	P53127	YGL074C	YGL074C	327 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SNT2	P53127	PBP2	YBR233W	1242 nt		4.78	□□□□□ -1.64

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