Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DAP3P51398 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DAP3P51398 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DAP3P51398 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DAP3P51398 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DAP3P51398 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DAP3P51398 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DAP3P51398 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DAP3P51398 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DAP3P51398 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DAP3P51398 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DAP3P51398 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DAP3P51398 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DAP3P51398 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DAP3P51398 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DAP3P51398 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DAP3P51398 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DAP3P51398 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DAP3P51398 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
DAP3P51398 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DAP3P51398 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DAP3P51398 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DAP3P51398 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DAP3P51398 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DAP3P51398 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DAP3P51398 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DAP3P51398 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DAP3P51398 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
DAP3P51398 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DAP3P51398 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DAP3P51398 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DAP3P51398 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DAP3P51398 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DAP3P51398 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DAP3P51398 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DAP3P51398 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DAP3P51398 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DAP3P51398 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DAP3P51398 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
DAP3P51398 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DAP3P51398 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DAP3P51398 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DAP3P51398 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DAP3P51398 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DAP3P51398 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DAP3P51398 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DAP3P51398 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DAP3P51398 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DAP3P51398 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DAP3P51398 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DAP3P51398 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
DAP3P51398 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DAP3P51398 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DAP3P51398 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DAP3P51398 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DAP3P51398 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DAP3P51398 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DAP3P51398 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DAP3P51398 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
DAP3P51398 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DAP3P51398 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DAP3P51398 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DAP3P51398 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
DAP3P51398 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DAP3P51398 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DAP3P51398 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
DAP3P51398 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DAP3P51398 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DAP3P51398 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DAP3P51398 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DAP3P51398 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DAP3P51398 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DAP3P51398 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DAP3P51398 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DAP3P51398 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DAP3P51398 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DAP3P51398 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DAP3P51398 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DAP3P51398 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
DAP3P51398 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DAP3P51398 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DAP3P51398 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
DAP3P51398 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DAP3P51398 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DAP3P51398 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DAP3P51398 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DAP3P51398 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
DAP3P51398 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DAP3P51398 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DAP3P51398 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DAP3P51398 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DAP3P51398 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DAP3P51398 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DAP3P51398 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DAP3P51398 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DAP3P51398 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DAP3P51398 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DAP3P51398 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DAP3P51398 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DAP3P51398 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms