Protein–RNA interactions for Protein: P51168

SCNN1B, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1BP51168 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCNN1BP51168 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNN1BP51168 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms